9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4899 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4899    100 
 
 
127 bp  252  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.33699  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  85.94 
 
 
678 bp  95.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  84.38 
 
 
678 bp  79.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  83.46 
 
 
678 bp  69.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4889    83.9 
 
 
728 bp  67.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3181    91.49 
 
 
681 bp  61.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4099    86.89 
 
 
663 bp  58  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  85.96 
 
 
678 bp  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3184    87.23 
 
 
681 bp  46.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.981757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>