17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14220 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  312  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  28.4 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  32.7 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  34.96 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  27.38 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  32.2 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14220  rod shape-determining protein MreD  23.24 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  23.02 
 
 
172 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  28.12 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1672  hypothetical protein  29.5 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  23.84 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  22.31 
 
 
160 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2373  hypothetical protein  27.83 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  27.97 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  32.89 
 
 
164 aa  40.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>