More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5650 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  100 
 
 		 80 aa  157  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  94  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  57.5 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  67.61 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  57.97 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  62.32 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  56 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 74 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  54.79 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>