12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2918 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  100 
 
 
1090 aa  2169    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  80.28 
 
 
1393 aa  1297    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  27.27 
 
 
1333 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  25.45 
 
 
1343 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0656  hypothetical protein  30.88 
 
 
598 aa  141  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.993667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  32.51 
 
 
1420 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  32.24 
 
 
1545 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  34.76 
 
 
755 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  35.62 
 
 
1637 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  35.62 
 
 
1503 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  27.86 
 
 
1442 aa  102  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  34.48 
 
 
862 aa  45.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.454504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>