36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2865 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2865  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.608797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  90.84 
 
 
131 aa  239  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0885  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1039  hypothetical protein  37.23 
 
 
174 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1215  hypothetical protein  37.63 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481243  hitchhiker  0.000377554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0595  hypothetical protein  38.71 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0948  hypothetical protein  34.04 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0612  hypothetical protein  34.04 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588656  normal  0.537903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1120  hypothetical protein  36.17 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037365  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0957  hypothetical protein  35.56 
 
 
171 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229452  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0816  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0758  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1211  hypothetical protein  34.41 
 
 
183 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634004  hitchhiker  0.00000168855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0705  hypothetical protein  35.87 
 
 
181 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1035  hypothetical protein  34.44 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1115  hypothetical protein  34.78 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1042  hypothetical protein  33.7 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0880  hypothetical protein  33.94 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000327816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0951  hypothetical protein  35.56 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0760  hypothetical protein  32.14 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0755  hypothetical protein  35.96 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0769  hypothetical protein  34.95 
 
 
177 aa  57.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0939  hypothetical protein  32.97 
 
 
179 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290636  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0890  hypothetical protein  33.7 
 
 
173 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0893  hypothetical protein  32.61 
 
 
178 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0627  hypothetical protein  34.55 
 
 
181 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0702  hypothetical protein  34.86 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1112  hypothetical protein  33.7 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1065  hypothetical protein  30.53 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0619  hypothetical protein  33.7 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0615  hypothetical protein  30.23 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  41.43 
 
 
154 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  35.29 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  34.52 
 
 
172 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  42 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>