14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1423 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1423  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1192  hypothetical protein  27.57 
 
 
325 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4806  hypothetical protein  27.5 
 
 
369 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1093  hypothetical protein  26.91 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0572  hypothetical protein  28.67 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2168  hypothetical protein  30.4 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00211632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2526  hypothetical protein  30.52 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0371  hypothetical protein  27.08 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0737  PEGA domain protein  25.71 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0929  hypothetical protein  25.39 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  26.62 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3826  hypothetical protein  26.84 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0247874  normal  0.0380189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2825  hypothetical protein  28.7 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  27.48 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>