13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0135 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0135  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.697287  normal  0.0496902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2417  hypothetical protein  79.22 
 
 
78 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0830  hypothetical protein  59.72 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 
449 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4288  hypothetical protein  45.45 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0178694  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  44.12 
 
 
896 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  44.07 
 
 
843 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
817 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  46 
 
 
1081 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4828  hypothetical protein  37.68 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
994 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
786 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  39.22 
 
 
919 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>