13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3406 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  88.52 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  88.08 
 
 		 407 aa  551  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  48.87 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  36.96 
 
 		 373 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  36.39 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  34.23 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  38.28 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  31.6 
 
 		 380 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  33.22 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  32.7 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  34.98 
 
 		 403 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  45.61 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>