42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3062 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  100 
 
 
584 aa  1206    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 
558 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  23.87 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3154  hypothetical protein  25.64 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  26.69 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3440  hypothetical protein  26.82 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  38.96 
 
 
628 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1891  hypothetical protein  33.64 
 
 
135 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092595 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
687 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  36 
 
 
692 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2819  transposase (ISH3)  21.86 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3590  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3324  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3351  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3362  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3398  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3434  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3509  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3562  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3317  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3595  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3599  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3628  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2781  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2748  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2904  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3300  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2092  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0981749  normal  0.0159333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1759  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00951972  normal  0.0115894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1757  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0120341  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3214  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3210  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3203  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2826  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3107  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3067  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2983  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2978  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2855  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2939  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2913  transposase (ISH3)  21.58 
 
 
388 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>