60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3210 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2939  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1757  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0120341  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2819  transposase (ISH3)  99.74 
 
 
388 aa  800    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2826  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2855  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3214  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2877  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  690    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2904  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2913  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2781  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2978  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2983  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3210  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3562  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3067  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3107  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3203  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2748  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1759  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00951972  normal  0.0115894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2092  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0981749  normal  0.0159333 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3300  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3317  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3590  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3324  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3351  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3362  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3398  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3434  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3595  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3599  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3628  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3509  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  801    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1460  transposase (ISH3)  82.78 
 
 
389 aa  627  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2799  transposase (ISH3)  65.12 
 
 
381 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3021  transposase (ISH3)  64.86 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3110  transposase (ISH3)  64.86 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  29.86 
 
 
379 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0458  hypothetical protein  26.39 
 
 
374 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0417  hypothetical protein  26.83 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3516  transposase IS4 family protein  29.46 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1840  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156024  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1606  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1024  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.765298  normal  0.715821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0054  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00175854 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3439  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2857  transposase IS4 family protein  30.61 
 
 
390 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0795  transposase  25.46 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0638  transposase  25.46 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0161  hypothetical protein  24.47 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0893  hypothetical protein  22.28 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  27.91 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  25.62 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  21.58 
 
 
584 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1909  hypothetical protein  26 
 
 
209 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231883  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0678  hypothetical protein  23.4 
 
 
150 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 
364 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>