45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1623 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
363 aa  700    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  66.67 
 
 
340 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  65.6 
 
 
341 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  63.14 
 
 
337 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  41.57 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  42.49 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  37.75 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  36.75 
 
 
343 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  47.06 
 
 
340 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  36.75 
 
 
343 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  36.49 
 
 
348 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  37.93 
 
 
348 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  36.47 
 
 
349 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  41.54 
 
 
346 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  39.58 
 
 
333 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  38.89 
 
 
333 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  38.89 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  39.16 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  41.03 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  38.77 
 
 
359 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  44.36 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  42.26 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  38.68 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  33.54 
 
 
365 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  39.49 
 
 
333 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  38.16 
 
 
333 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  40.99 
 
 
330 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  40.96 
 
 
329 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  41.82 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  39.05 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  41.39 
 
 
337 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  39.05 
 
 
334 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  35.23 
 
 
360 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  40.86 
 
 
336 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  40.23 
 
 
336 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  40.86 
 
 
336 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  38.55 
 
 
340 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  38.97 
 
 
340 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  34.59 
 
 
353 aa  149  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  34.81 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  34.81 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  40.29 
 
 
335 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  31.69 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  32.27 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  30.68 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>