16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0795 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0795  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3552  transcription repressor CinR  77.59 
 
 
119 aa  192  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.498012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1771  hypothetical protein  78.07 
 
 
114 aa  187  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0387  transcriptional regulator, MarR family  74.14 
 
 
116 aa  184  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2319  transcription repressor CinR  74.56 
 
 
114 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.628193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1565  hypothetical protein  36.94 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  35.65 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0137  hypothetical protein  39.62 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.536436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0176  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1540  hypothetical protein  39.42 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  49.21 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1614  hypothetical protein  41.11 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.19093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3598  hypothetical protein  35.79 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1204  hypothetical protein  37.36 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0300444 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1396  hypothetical protein  42 
 
 
291 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>