34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0500 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0500  cobalt transport protein  100 
 
 
237 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0888  cobalt transport protein  58.3 
 
 
234 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2737  cobalt transport protein  57.73 
 
 
234 aa  232  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0506  cobalt transport protein  50.85 
 
 
246 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.51 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  30.77 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  29.41 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  25 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.03 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.57 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.11 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.11 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25.11 
 
 
264 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  24.66 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  21.88 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.22 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  21.88 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.24 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  26.87 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.81 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.71 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.89 
 
 
810 aa  45.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.78 
 
 
268 aa  45.1  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.78 
 
 
268 aa  45.1  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.18 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.29 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  27.21 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  29.86 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  27.46 
 
 
270 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>