15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2028 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2087  hypothetical protein  52.24 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  34.97 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  34.36 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  34.92 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  38.52 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  36.43 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0647411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  28.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  32.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1961  hypothetical protein  29.81 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0180384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>