14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1147 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  100 
 
 		 859 aa  1765    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  42.41 
 
 		 829 aa  693    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  41.95 
 
 		 840 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 845 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  28.91 
 
 		 847 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  26.78 
 
 		 834 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  28.98 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  26.31 
 
 		 861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  25.47 
 
 		 857 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  25.07 
 
 		 701 aa  92  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  31.53 
 
 		 683 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.43 
 
 		 954 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  28.69 
 
 		 690 aa  45.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.79 
 
 		 909 aa  44.3  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>