28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3238 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3238  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  487  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3201  protein of unknown function DUF34  37.18 
 
 
234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.266326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6249  protein of unknown function DUF34  34.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2576  protein of unknown function DUF34  28.37 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.011272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  26.24 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  25.53 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  27.14 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  24.82 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  24.82 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  25.71 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  24.82 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  24.82 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  24.44 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  25.71 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  25.71 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  25.71 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  25.71 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  25.71 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  25.71 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  25.71 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2161  protein of unknown function DUF34  25.34 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.022584  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  24.11 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4390  protein of unknown function DUF34  25.5 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  24.11 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0233  hypothetical protein  24.11 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0272688  normal  0.647258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  23.13 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>