20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1412 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0006  hypothetical protein  31.89 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3145  protein of unknown function DUF1449  33.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0264  hypothetical protein  31.41 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0832208  normal  0.0172457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2881  protein of unknown function DUF1449  33.71 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752639  normal  0.082564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2817  hypothetical protein  27.49 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2900  hypothetical protein  27.49 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1083  hypothetical protein  29.67 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1376  hypothetical protein  25.59 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2997  hypothetical protein  27.4 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3021  hypothetical protein  30.1 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01974  hypothetical protein  31.51 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3316  protein of unknown function DUF107  26.92 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02870  hypothetical protein  22.96 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02920  predicted inner membrane protein  22.96 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3513  putative inner membrane protein  22.96 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3226  putative inner membrane protein  22.96 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.507681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0650  protein of unknown function DUF1449  22.96 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3342  putative inner membrane protein  22.56 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0649  hypothetical protein  22.96 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>