37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01974 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01974  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0945  hypothetical protein  35.27 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2219  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.185785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0803  hypothetical protein  34.29 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1083  hypothetical protein  31.28 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1185  hypothetical protein  32.69 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1376  hypothetical protein  32.38 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3110  hypothetical protein  31.1 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1266  protein of unknown function DUF1449  31.1 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.654061  hitchhiker  0.000225209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3100  hypothetical protein  31.9 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2900  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3253  hypothetical protein  31.9 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2997  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2817  hypothetical protein  31.58 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3623  hypothetical protein  33.18 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3553  inner membrane protein YqiJ  36.5 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3383  inner membrane protein YqiJ  36.5 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3451  hypothetical protein  36.5 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.674317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3457  inner membrane protein YqiJ  36.5 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.832198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3387  inner membrane protein YqiJ  36.5 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3226  putative inner membrane protein  32.35 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.507681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02920  predicted inner membrane protein  32.35 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02870  hypothetical protein  32.35 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3513  putative inner membrane protein  32.35 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0650  protein of unknown function DUF1449  32.35 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3342  putative inner membrane protein  32.35 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0006  hypothetical protein  30.1 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0649  hypothetical protein  32.35 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2196  hypothetical protein  31.97 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.710845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4674  hypothetical protein  31.51 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1795  hypothetical protein  27.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0681  protein of unknown function DUF1449  30.99 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00978896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3021  hypothetical protein  30.37 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0669  hypothetical protein  30.99 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.609229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2881  protein of unknown function DUF1449  25.89 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752639  normal  0.082564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3145  protein of unknown function DUF1449  25 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1412  hypothetical protein  31.51 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>