37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02870 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3226  putative inner membrane protein  99.52 
 
 
209 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.507681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02870  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3342  putative inner membrane protein  99.52 
 
 
209 aa  423  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02920  predicted inner membrane protein  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0650  protein of unknown function DUF1449  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0649  hypothetical protein  99.52 
 
 
209 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3513  putative inner membrane protein  99.04 
 
 
209 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3451  hypothetical protein  72.41 
 
 
206 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.674317  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3553  inner membrane protein YqiJ  71.92 
 
 
206 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3383  inner membrane protein YqiJ  71.92 
 
 
206 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3457  inner membrane protein YqiJ  71.92 
 
 
206 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.832198  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3387  inner membrane protein YqiJ  70.44 
 
 
206 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2219  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.185785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0803  hypothetical protein  33.66 
 
 
211 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1083  hypothetical protein  31.79 
 
 
211 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01974  hypothetical protein  32.35 
 
 
204 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3253  hypothetical protein  31.5 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1376  hypothetical protein  31 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3100  hypothetical protein  31.5 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3110  hypothetical protein  31.5 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1266  protein of unknown function DUF1449  31.5 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.654061  hitchhiker  0.000225209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2817  hypothetical protein  31 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2900  hypothetical protein  31 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2997  hypothetical protein  31 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1185  hypothetical protein  31.66 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3623  hypothetical protein  29.95 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3021  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0006  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204292  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0945  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0681  protein of unknown function DUF1449  29 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00978896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3145  protein of unknown function DUF1449  30.22 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630907  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2196  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.710845  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1795  hypothetical protein  28.12 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2881  protein of unknown function DUF1449  27.87 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752639  normal  0.082564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0669  hypothetical protein  29.5 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.609229 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4674  hypothetical protein  28.79 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1412  hypothetical protein  22.96 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>