94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0757 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  746    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00822363 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1800  transposase  37.17 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0145233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00080  MULE transposase family protein  32.89 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0364986  normal  0.0762931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1518  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.639891  normal  0.149625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2243  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106828  normal  0.567143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0614  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000406094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2751  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2960  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0011  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0669  hypothetical protein  25.65 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.051771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2410  hypothetical protein  25.65 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06390  transposase  37 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00660  transposase  37 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2477  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0883  transposase  27.03 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.017573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0881  transposase  27.03 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0367  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2337  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1360  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000208004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1343  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1080  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.765479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1053  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0894608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1163  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0986  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0705  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0673  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0551  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0116  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.217246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0516  transposase  31.68 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4741  transposase, mutator type  31.73 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0604  transposase, mutator type  31.73 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2066  transposase, mutator type  31.73 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0791542 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5433  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1475  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0937  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0840  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5584  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 464 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5459  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5450  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790531  normal  0.0527916 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5923  transposase, mutator type  29.82 
 
 		 469 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5856  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5830  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5521  transposase, mutator type  29.82 
 
 		 469 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.380612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1439  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 434 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5387  transposase, mutator type  30.77 
 
 		 438 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  32.67 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0448  IS256 family transposase  31.68 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.495192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2045  transposase mutator type  29.55 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2675  transposase mutator type  30.19 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1542  transposase mutator type  30.19 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0418  transposase mutator type  30.19 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.434631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  31.68 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0294  transposase mutator type  34 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4276  transposase mutator type  34 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4286  transposase mutator type  34 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4304  transposase mutator type  34 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26589  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  30.69 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  30.69 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  30.69 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5130  transposase mutator type  28.15 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  27.36 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  27.36 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1955  transposase  27.45 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1822  transposase  27.45 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5266  transposase mutator type  28.15 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.801188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  32.26 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  32.26 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  32.26 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0119  transposase mutator type  32.69 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  26.42 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1303  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3331  hypothetical protein  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.354049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3105  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3061  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2572  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2302  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2013  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1890  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1733  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0304536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1718  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1694  transposase mutator type  31.63 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000397883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1469  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1261  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1250  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0873  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0010  transposase mutator type  31.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113874  normal  0.0774421 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0038  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3986  transposase, mutator type  29.55 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0135  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0186  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.183961 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0005  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3096  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2717  transposase mutator type  32.69 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  hitchhiker  0.000051751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2336  transposase mutator type  29.55 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>