More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1163 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0448  IS256 family transposase  82.35 
 
 
391 aa  693    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.495192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0116  transposase  100 
 
 
391 aa  815    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.217246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0516  transposase  98.98 
 
 
391 aa  803    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0551  transposase  99.49 
 
 
391 aa  810    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0673  transposase  98.98 
 
 
391 aa  803    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0705  transposase  98.98 
 
 
391 aa  803    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0986  transposase  98.98 
 
 
391 aa  802    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1053  transposase  98.72 
 
 
391 aa  800    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0894608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1080  transposase  98.72 
 
 
391 aa  800    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.765479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1163  transposase  100 
 
 
391 aa  815    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1343  transposase  98.72 
 
 
391 aa  802    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1360  transposase  98.72 
 
 
391 aa  802    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000208004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2337  transposase  98.98 
 
 
391 aa  803    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2477  transposase  98.98 
 
 
391 aa  803    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0367  transposase  97.44 
 
 
391 aa  794    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0881  transposase  96.16 
 
 
391 aa  782    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0883  transposase  96.16 
 
 
391 aa  783    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.017573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0888  transposase  96.93 
 
 
391 aa  783    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.261933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0366  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3446  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1658  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2822  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0762  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0812  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1665  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1695  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2801  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0332  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000243089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2842  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2886  transposase mutator type  38.56 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0161  transposase mutator type  38.3 
 
 
388 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2917  transposase mutator type  38.3 
 
 
388 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2336  transposase mutator type  35.11 
 
 
390 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0386  transposase mutator type  35.11 
 
 
374 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0140142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  33.77 
 
 
402 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  33.77 
 
 
402 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  33.77 
 
 
402 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  33.77 
 
 
402 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  32.79 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  32.01 
 
 
402 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  32.72 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  32.72 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  32.72 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  32.85 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  32.8 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  31.75 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  30.24 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  31.75 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  31.75 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  31.75 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  33.15 
 
 
402 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  34.11 
 
 
425 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  32.51 
 
 
415 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  33.43 
 
 
403 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  34.11 
 
 
425 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  34.11 
 
 
425 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  33.13 
 
 
404 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  32.88 
 
 
415 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>