25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4194 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  58.51 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  59.76 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  59.26 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0513  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  55.22 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  33.78 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  31.08 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  29.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  28.38 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  35.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  34.72 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  29.87 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  33.77 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  32.5 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0906  hypothetical protein  35.06 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.866498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  32.88 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  32.05 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  31.51 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  28.17 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  40.54 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>