26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4040 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  79.07 
 
 
473 aa  781    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  973    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  41.04 
 
 
473 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  39.29 
 
 
474 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  32.43 
 
 
1063 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  43.67 
 
 
256 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  25 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  26.02 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  25.34 
 
 
485 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  25.3 
 
 
473 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  24.1 
 
 
507 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  24.8 
 
 
477 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  25.86 
 
 
474 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  29.45 
 
 
482 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  24.55 
 
 
480 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  26.06 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  22.96 
 
 
518 aa  84  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  26.27 
 
 
517 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  22.81 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  22.83 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1332  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  27.8 
 
 
751 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000692737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3970  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  23.87 
 
 
764 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2500  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  21.63 
 
 
631 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440575  normal  0.181301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5718  hypothetical protein  54.76 
 
 
157 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2483  piwi domain-containing protein  25.08 
 
 
771 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1797  hypothetical protein  31.82 
 
 
626 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329046  hitchhiker  0.00296843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>