18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3792 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  40.18 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  33.62 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3150  hypothetical protein  39.29 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3251  hypothetical protein  38.26 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.072777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3052  hypothetical protein  38.26 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  35.63 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  25.21 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  29.06 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  30.4 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  27.45 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  27.68 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2414  hypothetical protein  26.02 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.437891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2354  hypothetical protein  28.95 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00810351  hitchhiker  0.0000298735 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  24.32 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5221  hypothetical protein  30.77 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  26.13 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>