19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2893 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  226  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  64.41 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  59.65 
 
 
116 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  63.56 
 
 
118 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  53.04 
 
 
115 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  56.14 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  52.73 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  41.75 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  39.29 
 
 
114 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  27.55 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  27.55 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  26.09 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  36.51 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  40.32 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1964  hypothetical protein  28.79 
 
 
120 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2325  hypothetical protein  28.79 
 
 
120 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.142274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  34.41 
 
 
204 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  36.25 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>