19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2856 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
376 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  59.31 
 
 
378 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  59.63 
 
 
378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  57.1 
 
 
390 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 
393 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
380 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  39.14 
 
 
380 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
366 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
364 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
363 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  37.19 
 
 
350 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
390 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  32.03 
 
 
353 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
357 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  24.66 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2804  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  21.39 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>