14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1649 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  58.16 
 
 
105 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  57.73 
 
 
102 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  57.78 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  46.46 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  45.45 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  41.24 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  43.53 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  40.23 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  37.21 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  48.08 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  36.59 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  46.81 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  35.53 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>