17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0328 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  57.56 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  55.83 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  57.06 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0755  4-vinyl reductase 4VR  50.9 
 
 		 182 aa  184  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  50.29 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  48.8 
 
 		 181 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  49.38 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  26.49 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  22.97 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  28.16 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  28.57 
 
 		 272 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 269 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  33.73 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>