22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3655 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  47.41 
 
 
258 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  45.93 
 
 
239 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  43.48 
 
 
301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.31 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  49.38 
 
 
281 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  41.35 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  38.91 
 
 
270 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  37.21 
 
 
242 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  34.63 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  43.61 
 
 
180 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  31.71 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  31.3 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  30.67 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  28.75 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3566  hypothetical protein  33.09 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.01 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  27.32 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  29.02 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>