20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5617 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  45.42 
 
 
238 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  43.93 
 
 
238 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  40.78 
 
 
270 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  49.01 
 
 
180 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  36.59 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  34.32 
 
 
242 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  35.62 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  31.03 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  32.54 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  35.58 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  36.32 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  27.39 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.64 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  30.73 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  29.86 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.73 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  28.51 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  40.91 
 
 
192 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>