20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  56.96 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  66.67 
 
 		 281 aa  231  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  50.2 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  47.41 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3566  hypothetical protein  53.66 
 
 		 203 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.17 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  50 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  39.29 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  39.73 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  34.41 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  40.45 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  44.2 
 
 		 180 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  32.5 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  30.98 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  28.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  27.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  28.57 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  29.19 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>