34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2630 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2630  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 105 aa  203  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  66.67 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1417  hypothetical protein  58.7 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  40.96 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  34.12 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  34.12 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  34.12 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  23.23 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  33.73 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  30.95 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 382 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  23.91 
 
 		 390 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  38.36 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>