11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_R0047 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0896302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0021  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0046  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0026  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.1113400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>