23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3077 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  39.33 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0261  prevent-host-death family protein  38.71 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.879783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0205  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  38.2 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  39.08 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1056  hypothetical protein  35.63 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.691667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2966  prevent-host-death family protein  38.71 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00596285  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  52 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  52 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1621  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  53.85 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  46 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2397  prevent-host-death family protein  38.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2602  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4173  prevent-host-death protein  34.09 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13419  hypothetical protein  43.9 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000985645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2386  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 97 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  47.37 
 
 		 83 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>