17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2925 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2925  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0581783  hitchhiker  0.000000000000134727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  66.67 
 
 
80 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3409  hypothetical protein  57.14 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1709  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3502  hypothetical protein  52.17 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2462  hypothetical protein  52.17 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0670  hypothetical protein  47.83 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0683  hypothetical protein  47.83 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000953444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2915  hypothetical protein  48.57 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0257114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1717  hypothetical protein  47.73 
 
 
85 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3648  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  42.62 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  37.7 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  41.27 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>