11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1140 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1140  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  794    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1746  hypothetical protein  57.47 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.681924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2553  hypothetical protein  52.76 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  28.96 
 
 		 833 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1183 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1168 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  32.56 
 
 		 814 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  41.67 
 
 		 773 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  40.24 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  40.24 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  40.24 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>