16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3609 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  57.23 
 
 
176 aa  201  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  52.05 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  51.52 
 
 
178 aa  189  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  53.01 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  48.5 
 
 
181 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0755  4-vinyl reductase 4VR  47.24 
 
 
182 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  49.38 
 
 
177 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  30.23 
 
 
267 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  25.32 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  25.93 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  48.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  23.73 
 
 
278 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  25.5 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  28.83 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
259 aa  44.7  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.989074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>