20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1444 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
281 aa  584  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  66.43 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  53.43 
 
 
281 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  52.55 
 
 
284 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  43.68 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  35.85 
 
 
258 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  29.28 
 
 
250 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  37.76 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  29.2 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  27.56 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  26.59 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  32 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  25.55 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  26.95 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  26.48 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  27.74 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  31.03 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  24.45 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3015  hypothetical protein  24 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.667221  normal  0.0266748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>