26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3217 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  100 
 
 		 835 aa  1681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  30.45 
 
 		 878 aa  333  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  33.07 
 
 		 862 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  32.52 
 
 		 901 aa  328  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  29.99 
 
 		 892 aa  311  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  35.55 
 
 		 890 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  30.98 
 
 		 893 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  29.16 
 
 		 881 aa  238  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  28.63 
 
 		 910 aa  237  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  27.31 
 
 		 888 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  27.92 
 
 		 899 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  27.23 
 
 		 899 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  28.44 
 
 		 938 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  27.9 
 
 		 832 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  26.26 
 
 		 820 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  26.64 
 
 		 815 aa  111  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  26.7 
 
 		 846 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  26 
 
 		 844 aa  98.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  23.27 
 
 		 726 aa  82  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  34.25 
 
 		 185 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  21.99 
 
 		 714 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  22.44 
 
 		 743 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  21.65 
 
 		 714 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  21.93 
 
 		 714 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  21.93 
 
 		 714 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  22.2 
 
 		 714 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>