21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2780 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  807    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  84.09 
 
 
398 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  88.16 
 
 
402 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  85.86 
 
 
397 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  84.52 
 
 
398 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  87.41 
 
 
397 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  75 
 
 
396 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  73.55 
 
 
396 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  73.48 
 
 
396 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  73.25 
 
 
398 aa  591  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  74.08 
 
 
401 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  74.35 
 
 
403 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  74.35 
 
 
403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  69.43 
 
 
398 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  53.42 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  87.28 
 
 
235 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  75.8 
 
 
167 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  68.79 
 
 
393 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  67.27 
 
 
172 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2917  hypothetical protein  26.7 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  23.55 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>