20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1047 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  76.38 
 
 
396 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  77.4 
 
 
396 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  816    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  80.78 
 
 
396 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  78.01 
 
 
403 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  72.54 
 
 
398 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  76.7 
 
 
403 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  73.9 
 
 
401 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  72.29 
 
 
398 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  73.13 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  72.91 
 
 
398 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  71.39 
 
 
397 aa  584  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  69.43 
 
 
397 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  70.65 
 
 
402 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  48.51 
 
 
402 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  78.03 
 
 
393 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  67.63 
 
 
235 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  73.25 
 
 
167 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  62.05 
 
 
172 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  23.72 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>