16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0468 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0468  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 426 aa  854    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  32.77 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  32.95 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  26.25 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.54 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  34.38 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  26.49 
 
 		 177 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  23.95 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  22.32 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  28.67 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  29.76 
 
 		 342 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  27.78 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>