42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0024 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  98.25 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646474  normal  0.266593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0046  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0041  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0044  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0920336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0020  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14016  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13370  tRNA-Gln  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0908228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32340  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.301649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0058  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0207136  hitchhiker  0.00175825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0332406  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGln01  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.794432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0047  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000306339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0049  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0025  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000105341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0003  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0013  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000776598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0042  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000577452  normal  0.10312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>