40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0037 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  98.15 
 
 		 75 bp  99.6  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1358  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11070  tRNA-Gln  89.71 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0049  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0047  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000306339 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0058  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0207136  hitchhiker  0.00175825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10730  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0676617  normal  0.337131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0047  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.953041  normal  0.766725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07683  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0017  tRNA-Gln  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.869148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0049  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0020  tRNA-Gln  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265513  normal  0.355823 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0040  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>