10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0040 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_R0040  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0048  tRNA-Gln  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  85.45 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>