29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4329 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  918    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  52.01 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  31.8 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  27.29 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  31.58 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  26.84 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  29.51 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  25.97 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  30.29 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  28.01 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  26.84 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  27.9 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  27.17 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  27.25 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  26.8 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  27.62 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  27.62 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  26.59 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  27.35 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  26.37 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  28.01 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  30.1 
 
 		 415 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  25.62 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40545  kynurenine 3-monooxygenase, mitochondrial precursor (Biosynthesis of nicotinic acid protein 4)  21.83 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.920586  normal  0.774077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  22.42 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  46.15 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2449  2,4-dienoyl-CoA reductase  33.9 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.980511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 378 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>