24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4435 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  100 
 
 
415 aa  854    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  64.02 
 
 
416 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  36.87 
 
 
413 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  30.94 
 
 
408 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  29.1 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  28.97 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  30.69 
 
 
415 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  29.25 
 
 
413 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  29.9 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  27.66 
 
 
416 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  28.01 
 
 
429 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  31.42 
 
 
405 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  27.43 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  27.43 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  26.28 
 
 
417 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  28.29 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  25.94 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  26.23 
 
 
412 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  26.75 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  29 
 
 
461 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  28.27 
 
 
463 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  25.55 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  26.29 
 
 
435 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>