24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4509 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 416 aa  862    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  64.02 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  35.38 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  31.38 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  29.61 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  28.99 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  28.79 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  28.85 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  31.98 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  29.55 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  28.71 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  28.71 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  28.67 
 
 		 429 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  28.88 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  28.22 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  27.55 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  26 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  25.89 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  27.34 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  27.25 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  25.62 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  26.36 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  22.55 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  25.26 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>