42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4181 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  100 
 
 		 333 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  64.37 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  64.16 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  62.69 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  62.27 
 
 		 331 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  62.39 
 
 		 331 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  62.27 
 
 		 348 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  61.56 
 
 		 332 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  56.05 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  52.01 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  28.89 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  28.22 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  28.25 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  28.12 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  29.05 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  28.38 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  28.76 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  26.69 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  28.41 
 
 		 353 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  28.7 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  26.12 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  26.12 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  26.06 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  28.57 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  28.34 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  27.07 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  26.88 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  25.92 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  25.79 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  25.79 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  24.93 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  24.92 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  29.38 
 
 		 160 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  24.32 
 
 		 166 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  24.32 
 
 		 166 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  29.3 
 
 		 150 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  25.3 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  25.3 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  25.3 
 
 		 161 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  27.06 
 
 		 166 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  28.1 
 
 		 171 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>