19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1708 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0876  hypothetical protein  42.14 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1138  hypothetical protein  44.4 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1165  hypothetical protein  44.4 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746782  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1155  hypothetical protein  44.4 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0655389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13475  hypothetical protein  45.42 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000130156  hitchhiker  0.00071947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4940  hypothetical protein  40.28 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1479  hypothetical protein  41.11 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04550  dienelactone hydrolase-like enzyme  42.37 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0809694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6559  dienelactone hydrolase-like protein  40.44 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1179  dienelactone hydrolase  34.53 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.401039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  32.47 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30 
 
 		 567 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.6 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  25.5 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.17 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  21.92 
 
 		 551 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  28.08 
 
 		 568 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  24.59 
 
 		 567 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>